O Programa de Pós-Graduação em Geologia e Geofísica Marinha - Mestrado e Doutorado tem como objetivo formar pessoal com capacitação para executar estudos, levantamentos, pesquisa pura e aplicada, bem como exercer atividades de ensino superior, nas áreas de geologia e geofísica marinha.  Este Programa formou até dezembro de 2009, 107 mestres.  O Curso de Doutorado em Geologia e Geofísica Marinha, aprovado pela CAPES, teve início ao final de 2001, contando ao final de 2009 com 16 alunos matriculados.  O Curso formou, até dezembro de 2009,  11 doutores.

Mantendo-se as atuais linhas de pesquisa e a filosofia básica de prover uma formação ampla em Geologia e Geofísica Marinha, o Programa também vem buscando atender às demandas atuais do mercado, principalmente para a capacitação de pessoal para a indústria do petróleo.  Neste sentido, destaca-se o convênio com a Agência Nacional de Petróleo, que vem inserindo recursos adicionais para bolsas de mestrado e professor visitante e para o custeio de despesas associadas a projetos de interesse na área do petróleo e a articulação com a Petrobras, para o desenvolvimento de projetos com recursos próprios da empresa ou com recursos do Fundo de Participações Especiais.